El nombre inicial del edificio iba a ser Burj Dubai, pero por la crisis económica que sufría Dubai en ese momento, parte del coste del edificio fue financiado por la familia del Emir Mohammed bin Rashid Al Maktoum, familia real de Abu Dhabi, así que por ello cambiaron el nombre en agradecimiento a la familia.

La forma de la base del Burj Khalifa esta basada en la forma geométrica de una flor, la Hymenocallis blanca de seis pétalos cultivada en la región de Dubai y en India.

Tomando como inspiración la Hymenocallis, la base del Burj Khalifa consiste en una Y, compuesta de arcos basados en los domos de la arquitectura islámica.